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Uniscience 20-03-2017

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Sequel System

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Sequel System

Maior capacidade e menor tamanho por uma fração do custo!

Sequel System, Uniscience Produtos para Laboratório, Pacbio

A Pacific Biosciences® acaba de lançar um novo equipamento utilizando a já consagrada plataforma de sequenciamento de molécula única em tempo real – SRTM® Technology. O Sequel possui capacidade 7x maior que o PacBio RSII, pois utiliza SMRT® cells com 1 milhão de nanopoços ZMWs. Dessa maneira, você pode agora utilizar uma plataforma com vantagens exclusivas, compreender informações biológicas essenciais nunca antes observadas!

Performance do Sequel System

– Leitura de longos fragmentos únicos (>60kb), assim como o RSII
– Atinge acurácia consenso QV50
– Capacidade por SMRT® cell:  ~5 – 10Gb
– Capacidade de processamento: 1 – 16 SMRT® Cells com 1 milhão de ZMWs cada
– Capacidade de registro de dados em vídeo que permite sequenciar moléculas longas por repetidas vezes: 30 minutos até 6 horas
– Instalação simplificada e tamanho 3 vezes menor que o RSII
– Inclui nova plataforma de software SMRT Link, com ferramentas para design e análise dos resultados do começo ao fim, gerenciamento de dados e controle de qualidade.

Acesse a brochura do Sequel clicando aqui.

Workflow para o Sequel System

O SMRT Sequencing workflow é o mesmo que outros sistemas PacBio. Não é necessária amplificação do DNA, preservando informações essenciais da amostra. O equipamento possui um sistema completamente automatizado que realiza o sequenciamento de amostras complexas em tempo recorde.

– Utiliza SMRT® Cells com 1 milhão de ZMWs, aumentando a capacidade de leitura em 7x por SMRT® Cell
– Sequenciamento de amplicons, RNA e até genomas complexos em apenas 1 ou 2 dias.

Sequel System, Uniscience Produtos para Laboratório, Pacbio

Sequel System, Uniscience Produtos para Laboratório, Pacbio

O software desenvolvido pela Pacific Biosciences® é extremamente simples, intuitivo e pode ser facilmente utilizado por diferentes profissionais, cientistas, bioinformatas e desenvolvedores. Além disso, o SMRT® Link, uma ferramentaweb-based, oferece novas ferramentas para planejamento das corridas desequenciamento, análise dos resultados, novos algoritmos para diferentes aplicações, gerenciamento de dados e testes de controle de qualidade.

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Sample Setup:

– Crie protocolos para preparação de amostras para sequenciamento
– Guias para utilização extremamente simples
– Armazene e acesse informações de duas amostras

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Run Design:

– Otimize seus protocolos e armazene seus parâmetros de corrida
– Estabeleça seus parâmetros para análise secundária dos dados

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Run QC:

-Monitore os parâmetros da corrida no equipamento
– Obtenha informações da qualidade do sequenciamento, carregamento da amostra, comprimento dos fragmentos e throughput

Sequel System, Uniscience Produtos para Laboratório, PacbioData Management:

– Crie grupos de SMRT® Cells e grupos de amostras por corrida, unificando dados de diferentes SMRT® Cells que podem ser analisados em conjunto
– Crie relatórios dos dados incluindo informações essenciais da qualidade do sequenciamento
– Organize os dados dos seus projetos
– Inclua permissões de utilização e compartilhamento de dados entre diferentes usuários

Sequel System, Uniscience Produtos para Laboratório, PacbioSMRT Analysis:

– Realize montagem de novo de genomas de diferentes tamanhos
– Alinhamento de sequências com dados de referência
– Identificação de variantes do genoma
– Detecção de metilação no DNA

 

Sequel Instrument Control Software (ICS)

Sequel System, Uniscience Produtos para Laboratório, Pacbio

O visor touchscreen permite acesso ao Sequel Instrument Control Software (ICS), um software integrado e simplificado com diversas ferramentas para utilização do equipamento. Por exemplo:

– Selecionar protocolos criados no SMRT Link
– Parâmetros do instrumento e monitoramento em tempo real
– Limpeza e manutenção do equipamento após a utilização
– Análise primária em tempo real através do Brade Center integrado, que inclui dados como distribuição dos fragmentos, velocidade da polimerase, qualidade do sequenciamento e dados de incorporação dos nucleotídeos em formato BAM.

Sequel System, Uniscience Produtos para Laboratório, Pacbio

Características do equipamento Sequel System

– Energia: 208 VAC e 240 VAC, recomendado uso de UPS
– Temperatura de operação: 19ºC – 25ºC (66.2ºF – 77ºF) ± 2°C por hora
– Umidade: 20% – 80%, sem condensação
– Ventilação: HVAC com capacidade 13,956 BTU (4090 Watts)
– Fonte de nitrogênio: 50 PSI (2,585 torr)
– Dimensões: comprimento 92cm x largura 86cm x altura 167cm
– Peso: 841 lb (381 kg)

 

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